تعمل دائما كلية طب الكندي على مواكبة كل ما من شانه رفعة الحركة العلمية. فمن ضمن الخطة الدراسية الجديدة المتبعة في مناهج كليات الطب اجتمعت لجنة عمداء كليات الطب في العراق ومجلس الجامعة وتم الاتفاق على اعتماد النظام التكاملي في التعليم والذي يكون الطالب فيه هو اساس عملية التعليم بدلا من النظام القديم الذي يعتمد على اعطاء المادة من قبل الفروع بصورة منفصلة.وقد بدأ تطبيق هذا النظام منذ بداية العام الحالي للسنة الدراسية الحالية 2013-2014 للمرحلة الاولى.وهذا النظام مطبق في معظم الجامعات العالمية الرصينة وهو جزء من متطلبات الاعتمادية العالمية ليكون الطريق نحو الاعتمادية لكليتنا سهل الوصول.وهذه الطريقة الجديدة في المناهج الدراسية تتيح للطلبة ترسيخ العلم لديهم مدى الحياة وليس كالنظام المتبع سابقا الذي يكون فيه التعلم مقتصر على مراحل الدراسة فقط.